رویداد۲۴ علی مطهری در توئیتی نوشت: کنارهگیری جناب صادق لاریجانی از شورای نگهبان یک کار حکیمانه بود. وقتی نهادی استقلال و فلسفه وجودی خود را از دست میدهد و فرمانبر و ابزار دست یک محفل امنیتی و اطلاعاتی میشود و دیگر نمیتوان از حقوق ملت دفاع کرد بهترین کار کنارهگیری است.
در جریان بررسی صلاحیت نامزدهای انتخابات ریاست جمهوری ۱۴۰۰ اختلاف نظرها در شورای نگهبان عیان شد. علی لاریجانی از سوی شورای نگهبان رد صلاحیت شد و آملی لاریجانی نسبت به تصمیم همکاران خود در این شورا معترض شد. وی در رشته توییتی به اعتراض به نحوه تصمیم گیری شورای نگهبان که به ردصلاحیت برادرش منجر شد شد پرداخت.
در نهایت در سیزدهم شهریور ماه سال ۱۴۰۰ رهبری با درخواست کناره گیری آملی لاریجانی از شورای نگهبان موافقت کرد.